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自2021年7月(yue)(yue)30日(ri)(ri)寧夏(xia)(xia)確診外省輸入(ru)病(bing)例張(zhang)某某，7月(yue)(yue)31日(ri)(ri)22時采集到合(he)格基(ji)(ji)因(yin)(yin)測(ce)(ce)(ce)序(xu)標本(ben)(ben)，中(zhong)心(xin)領導立即部署深度測(ce)(ce)(ce)序(xu)工(gong)作(zuo)，組(zu)(zu)織專業技(ji)術(shu)(shu)人員，日(ri)(ri)夜不(bu)停地開展測(ce)(ce)(ce)序(xu)工(gong)作(zuo)，通過文(wen)庫制備、簇(cu)生(sheng)成(cheng)、上(shang)機(ji)測(ce)(ce)(ce)序(xu)與數據比對(dui)分析，最終(zhong)在36小時后，于8月(yue)(yue)2日(ri)(ri)完成(cheng)該(gai)病(bing)例全基(ji)(ji)因(yin)(yin)組(zu)(zu)測(ce)(ce)(ce)序(xu)，確定(ding)(ding)該(gai)標本(ben)(ben)為德爾塔毒(du)株(zhu)。通過與國家(jia)疾控(kong)(kong)中(zhong)心(xin)的數據庫比對(dui)，該(gai)病(bing)例基(ji)(ji)因(yin)(yin)組(zu)(zu)序(xu)列和江蘇(su)省7月(yue)(yue)24日(ri)(ri)以來報送(song)本(ben)(ben)土病(bing)例新冠病(bing)毒(du)基(ji)(ji)因(yin)(yin)組(zu)(zu)完全一致(zhi)，共享全部突變位點，高度同源。此次基(ji)(ji)因(yin)(yin)組(zu)(zu)測(ce)(ce)(ce)序(xu)工(gong)作(zuo)的完成(cheng)，標志著(zhu)寧夏(xia)(xia)疾病(bing)預防控(kong)(kong)制中(zhong)心(xin)已(yi)具備新冠病(bing)毒(du)基(ji)(ji)因(yin)(yin)組(zu)(zu)高通量二代測(ce)(ce)(ce)序(xu)能力，可為寧夏(xia)(xia)新型冠狀病(bing)毒(du)疫情(qing)以及(ji)其他傳染病(bing)病(bing)原體的鑒定(ding)(ding)和溯源、防控(kong)(kong)應(ying)對(dui)提供(gong)技(ji)術(shu)(shu)支(zhi)撐。
基(ji)因組測序(xu)(xu)可在(zai)第一(yi)時間獲取新(xin)(xin)發未知病(bing)(bing)(bing)毒(du)的基(ji)因組序(xu)(xu)列(lie)信息，已(yi)成為研究疾病(bing)(bing)(bing)暴發的重要工具。通過(guo)構(gou)建進(jin)化樹(shu)(shu)，研究不(bu)同(tong)患者病(bing)(bing)(bing)毒(du)遺傳(chuan)序(xu)(xu)列(lie)變化，能在(zai)分(fen)(fen)子生(sheng)物學(xue)層面揭示病(bing)(bing)(bing)毒(du)的傳(chuan)播方(fang)式，分(fen)(fen)析新(xin)(xin)冠病(bing)(bing)(bing)毒(du)的進(jin)化來(lai)源，研究新(xin)(xin)冠病(bing)(bing)(bing)毒(du)的致(zhi)病(bing)(bing)(bing)病(bing)(bing)(bing)理機制(zhi)，為控制(zhi)疫情暴發提供(gong)科(ke)學(xue)依據。通過(guo)檢測新(xin)(xin)冠病(bing)(bing)(bing)毒(du)的全(quan)基(ji)因組序(xu)(xu)列(lie)，再將這個序(xu)(xu)列(lie)通過(guo)算法與數(shu)據庫中的數(shu)據進(jin)行比對，可以初(chu)步(bu)判斷(duan)其地域來(lai)源。將序(xu)(xu)列(lie)與既往病(bing)(bing)(bing)例序(xu)(xu)列(lie)進(jin)行比對，如(ru)果序(xu)(xu)列(lie)在(zai)同(tong)一(yi)進(jin)化樹(shu)(shu)分(fen)(fen)支上(shang)，則可以判斷(duan)這些(xie)病(bing)(bing)(bing)例是(shi)否來(lai)自同(tong)一(yi)傳(chuan)播鏈(lian)或傳(chuan)染源。
此次疫情(qing)病(bing)(bing)原(yuan)體為德爾塔變(bian)(bian)異株(zhu)，德爾塔變(bian)(bian)異株(zhu)與其他變(bian)(bian)異株(zhu)相比，在S蛋白上(shang)新增了“L452R”、“T478K”和“P681R”3個重要(yao)突(tu)變(bian)(bian)。這(zhe)些突(tu)變(bian)(bian)導致病(bing)(bing)毒(du)具有傳播力強、潛伏期短(duan)、病(bing)(bing)毒(du)載(zai)量高、病(bing)(bing)程進展快等特(te)點。在此提醒廣大(da)群眾，減(jian)少(shao)聚(ju)集，保持社交(jiao)距離，防止疫情(qing)擴散。
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