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寧夏疾病預防控制中心首次開展新冠病例基因溯源檢測工作

訪問(wen)量: 69來源:本(ben)站作者(zhe): 時間:2022-08-05分享:

  自2021年(nian)7月30日寧夏(xia)確診外(wai)省(sheng)輸入病(bing)(bing)(bing)(bing)例張某(mou)某(mou),7月31日22時采集到合(he)格(ge)基(ji)因測(ce)序標(biao)(biao)本(ben),中(zhong)心領(ling)導立(li)即部署深度測(ce)序工(gong)作(zuo)(zuo),組(zu)織(zhi)專(zhuan)業技術人員,日夜不停地開展測(ce)序工(gong)作(zuo)(zuo),通過(guo)文庫制備、簇生成、上機(ji)測(ce)序與數(shu)(shu)據(ju)比對(dui)分析,最(zui)終在(zai)36小時后,于8月2日完(wan)成該(gai)病(bing)(bing)(bing)(bing)例全基(ji)因組(zu)測(ce)序,確定(ding)該(gai)標(biao)(biao)本(ben)為德爾(er)塔毒株(zhu)。通過(guo)與國(guo)家(jia)疾控中(zhong)心的(de)數(shu)(shu)據(ju)庫比對(dui),該(gai)病(bing)(bing)(bing)(bing)例基(ji)因組(zu)序列(lie)和江(jiang)蘇(su)省(sheng)7月24日以(yi)來報送本(ben)土病(bing)(bing)(bing)(bing)例新冠病(bing)(bing)(bing)(bing)毒基(ji)因組(zu)完(wan)全一致,共(gong)享全部突變位點,高(gao)(gao)度同源。此次基(ji)因組(zu)測(ce)序工(gong)作(zuo)(zuo)的(de)完(wan)成,標(biao)(biao)志著(zhu)寧夏(xia)疾病(bing)(bing)(bing)(bing)預(yu)防(fang)(fang)控制中(zhong)心已(yi)具備新冠病(bing)(bing)(bing)(bing)毒基(ji)因組(zu)高(gao)(gao)通量(liang)二代測(ce)序能力,可為寧夏(xia)新型冠狀病(bing)(bing)(bing)(bing)毒疫情以(yi)及其(qi)他傳染病(bing)(bing)(bing)(bing)病(bing)(bing)(bing)(bing)原體(ti)的(de)鑒定(ding)和溯源、防(fang)(fang)控應對(dui)提供技術支撐。
  基(ji)因組測(ce)序(xu)可在第一時間獲(huo)取新(xin)(xin)發未知病(bing)毒(du)(du)的(de)基(ji)因組序(xu)列信息,已成(cheng)為(wei)研(yan)究疾病(bing)暴發的(de)重要工具。通(tong)過構建進化樹,研(yan)究不同(tong)患者病(bing)毒(du)(du)遺傳(chuan)序(xu)列變化,能在分子生(sheng)物(wu)學層(ceng)面揭示病(bing)毒(du)(du)的(de)傳(chuan)播方式,分析新(xin)(xin)冠(guan)病(bing)毒(du)(du)的(de)進化來源,研(yan)究新(xin)(xin)冠(guan)病(bing)毒(du)(du)的(de)致病(bing)病(bing)理機(ji)制(zhi),為(wei)控(kong)制(zhi)疫情暴發提供科學依據。通(tong)過檢測(ce)新(xin)(xin)冠(guan)病(bing)毒(du)(du)的(de)全基(ji)因組序(xu)列,再將(jiang)這(zhe)個序(xu)列通(tong)過算法與數(shu)據庫中的(de)數(shu)據進行比對(dui),可以初步(bu)判(pan)(pan)斷其(qi)地域來源。將(jiang)序(xu)列與既往(wang)病(bing)例序(xu)列進行比對(dui),如果序(xu)列在同(tong)一進化樹分支上(shang),則可以判(pan)(pan)斷這(zhe)些病(bing)例是否來自同(tong)一傳(chuan)播鏈或傳(chuan)染源。
  此次疫情病(bing)原體為德爾塔變(bian)(bian)異株(zhu)(zhu),德爾塔變(bian)(bian)異株(zhu)(zhu)與其他(ta)變(bian)(bian)異株(zhu)(zhu)相比,在(zai)S蛋白(bai)上新增了“L452R”、“T478K”和“P681R”3個重要突變(bian)(bian)。這些突變(bian)(bian)導致(zhi)病(bing)毒(du)(du)具有傳(chuan)播力強、潛伏期短、病(bing)毒(du)(du)載量高、病(bing)程進展快等特點(dian)。在(zai)此提醒廣大(da)群眾(zhong),減(jian)少聚集,保持社交距離,防止疫情擴(kuo)散。

 

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